微生物檢測儀器的工作原理是ATP熒光法，ATP在一切生物的細胞中都含有，經過熒光劑與ATP反響發光的現象，確定樣品中微生物的含量，從而判斷食品能否被污染，能否經過消毒。由于一切活細胞都含有恒定的ATP，因而ATP含量能夠清楚地表達樣品中微生物和其他生物的殘留量，并應用這些數據來判別衛生情況。

　　微生物檢測儀器能夠依據環境檢測的請求設定上下限，快速評價預警數據，快速篩查外表清潔度，操作簡單，只需要簡單的培訓就能夠完成檢測，并且能夠直接進行現場操作，當場出具檢測結果。微生物快速測定儀是一種快速檢測儀器，能夠在短時間內得到檢測結果，儀器為外表衛生檢測提供了一種快速準確的檢測辦法。目前，儀器已經廣泛應用于各個行業。

微生物檢測儀器功能特點：

1) 可檢測固態、液態、表面、膏狀、漿狀樣本;

2) 樣本在檢測時無需任何的前處理過程，直接丟入檢測瓶即可;

3) 可自動控制孵育溫度和孵育時間

4) 檢測樣本只需1ml/1g;同一溫度下可同時檢測8個樣品;

5) 靈敏度高達可檢測到1目標微生物;特異性高達99.999%;

6) 獨立、持續的檢測并記錄瓶中的微生物數量(CFU)

7) 簡單三個操作步驟，傻瓜型，無需專業操作人員;

8) 儀器便攜式，可隨時隨地進行檢測、100%定量分析，并可直接連接電腦出定量分析檢測報告。

        微生物檢測儀器原理是測量一些帶生物標記的分子的水平。這些分子是由新陳代謝或繁殖中產生。因此檢測這些活性物質，可以得出結果。活性法和平板記數法是不同的測量方法。微生物檢測儀器測試法的基礎是好氧微生物，包括細菌和真菌。它們在新陳代謝時產生一種過氧化物酶，而微生物檢測儀器檢測的就是過氧化物酶。過氧化物酶的產生與生物活性的高低成一定比例。所以樣品中現存的酶的數量可以反應當前總的生物活性。通過微生物檢測儀器來檢測反應物與酶反應釋放氧氣，并轉換成生物活性數量讀出。